一、脐后肾前，大概在这个位置的地方被认为是玄关。《道法会元》卷八十四《归一密语》中记载：“有一个直径一寸左右的地方，包含着天、地、人三才，在肚脐的后方，肾脏的前方，大概在这个位置的地方被称为玄关，就是这个地方。现在如果不明确地指示出来，后来学习的人必定会胡乱猜测，不是理解得太过了，就是理解得不够。”这里所指出的玄关位置只是一个大概的范围。只有能够领悟到无我的境界，才能认识到真正的自我。同样在卷八十四《琼山紫清真人答隐芝书》中也提到：“玄关就是土，也是黄房，是呼气的根源，吸气的蒂结，也就是生命的蒂结，是真正的玄牝。在肚脐的后方，肾脏的前方，小肠的左边，大肠的右边，正处于中间的位置，有一个空闲的穴位，阳气舒展，阴气收敛，原本没有固定的形状，意念到达的时候它就会开启，开启和闭合都有一定的时机，所以说它是天地的根源，是结成丹的地方。”这里的说法与前面相同，只是明确了“意念到达就会开启”这一点，更加突出了“意念”的作用。二、人身的正中间被认为是玄关。唐朝的司马承祯说过：“虚无一窍被称为玄关，它正处于人的身体与天地之间的位置，人体的八万四千个部位有上下之分，按照九三六五的规律循环排列，它大到可以包容天地，广阔无边，小到可以细微到进入微尘之中而不见其形，这个地方被称为祖气穴，虚无一窍正悬挂在人身的正中间。”祖气就存在于人身的正中间位置。三、当一阳初生时出现的元精、真神被视为玄关。（1）在《仙佛合宗语录》中，李虚庵说：“一阳开始发动的时候就是玄关”“药物产生的时候，就是玄关窍开启的时候。”他还说：“这一玄关窍，就是玄牝之门，冬至的时候药物产生，火候的把握、沐浴的过程，以及结胎、脱胎等过程都与这个窍有关，这样一来，玄关一窍的要义就全部包含在其中了。”（2）清朝的柳华阳在《金仙证论》中提到：“气机发动的时候就会形成窍穴，气机停息的时候就变得渺茫不可寻。”这里所说的“气机”指的是元精。（3）清朝的李昌仁说：“离卦中的老阴被称为坤母姹女，坎卦中的老阳被称为灵父婴儿，老阴与老阳相互交合，产生出来的元精就叫做玄关。”当达到极度虚无、极度宁静的状态时，所产生的一阳来复就被称为元精。（4）在《大成捷要》内的《真阳发生天机》中，达摩祖师说：“玄关窍开启的时候，真神就会产生出来。”崔希范也说：“玄关透露的时候，真种即将产生，关键在于要把握好时机”，这里的真种就是指元精。